Tám năm trước, cha của Kaito Kuroba, một cậu thiếu niên bình thường đã bị chết một cách đầy bí ẩn. Tám năm sau, cậu dần phát hiện ra bí mật về người cha của mình, ông bị ám sát bới một tổ chức bí ẩn trong khi cố đánh cắp một vật mà tổ chức này đang truy tìm…