Cốt truyện diễn ra vào đầu thế kỷ 20, trong một xã hội mà thuật giả kim (là khoa học kỳ bí cổ đại nghiên cứu sự biến đổi của vật chất) là thật, cực kỳ phát triển và được mọi người tôn trọng. Bộ phim này nói về các anh em Edward (Ryosuke Yamada) và Alphonse Elric, người sau khi cố gắng nghiên cứu kỹ thuật bị cấm về sự biến đổi con người, đã phải chịu hậu quả. Alphonse mất toàn bộ cơ thể của mình trong khi Edward mất chân trái. Edward sau đó hy sinh cánh tay phải của mình để cứu lấy linh hồn anh t